Shin Megami Tensei V: Vengeance consta de dos sendas argumentales independientes: experimenta una ruta totalmente nueva, el "Canon de la venganza", una dramática epopeya de ajuste de cuentas por parte de los caídos, centrada en nuevos personajes y una enigmática cohorte de demonios, los qadištu, quienes urden sus oscuros designios al margen de la guerra entre los defensores del orden y aquellos que intentan desafiarlo. O explora la historia original narrada en Shin Megami Tensei V, el "Canon de la Creación": un conflicto eterno entre ángeles y demonios, en el que el protagonista lucha por el destino del mundo.Con su recién descubierto poder, el protagonista se aventura a través de Da'at, un enigmático mundo lleno de deidades mitológicas y tiranos demoníacos enfrentados en un constante conflicto por la supervivencia. En busca de respuestas, deberá forjar su propio camino en una batalla entre ángeles y demonios por sentenciar el destino del mundo.